Los 17 restantes eran los equipos de Segunda División, con la inclusión de los descendidos Almagro y Talleres y Los Andes que había conseguido el ascenso al ganar el Torneo de Tercera Divsión de 1938. Se jugó a una rueda de partidos, con 32 partidos para cada elenco.
Para dirimir el ascenso a Primera División se resolvió realizar un torneo con los 6 equipos mejor clasificados, que jugarían entre sí para ver quien obtenía el halago de jugar en Primera en 1940. El único descenso correspondió a Sportivo Buenos Aires.

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FICHA DEL CAMPEONATO

Acassuso (San Isidro)
All Boys (Floresta (Buenos Aires)
Almagro (Villa Ortúzar – Buenos Aires)
Argentino de Quilmes (Quilmes)
Argentinos Juniors (Paternal – Buenos Aires)
Atlanta (Villa Crespo – Buenos Aires)
Banfield (Banfield)
Barracas Central (Barracas-Buenos Aires)
Boca Juniors (La Boca – Buenos Aires)
Chacarita Juniors (Villa Crespo – Buenos Aires)
Colegiales (Colegiales-Buenos Aires)
Defensores de Belgrano (Núñez-Buenos Aires)
El Porvenir (Gerli)
Estudiantes (Villa Devoto-Buenos Aires)
Estudiantes de La Plata (La Plata)
Excursionistas (Belgrano-Buenos Aires)
Ferro Carril Oeste (Caballito – Buenos Aires)
Gimnasia y Esgrima La Plata (La Plata)
Huracán (Parque Patricios – Buenos Aires)
Independiente (Avellaneda)
Lanús (Lanús)
Los Andes (Lomas de Zamora)
Platense (Núñez – Buenos Aires)
Quilmes (Quilmes)
Racing Club (Avellaneda)
River Plate (Belgrano – Buenos Aires)
San Lorenzo (Boedo – Buenos Aires)
Sportivo Buenos Aires (Monte Castro-Buenos Aires)
Sportivo Dock Sud (Dock Sud)
Talleres (Remedios de Escalada)
Temperley (Temperley)
Tigre (Victoria)
Vélez Sarsfield (Villa Luro – Buenos Aires)

CAMPEON: SAN LORENZO DE ALMAGRO (Bs As)

CAMPEON 2º DIVISION: BANFIELD

Pos	Equipo	Pts	PJ	G	E	P	GF	GC	DIF
1.º	Banfield	28	16	14	0	2	55	15	40
2.º	All Boys	21	16	7	7	2	42	26	16
3.º	Barracas Central	21	16	8	5	3	32	28	4
4.º	Dock Sud	21	16	9	3	4	34	30	4
5.º	Temperley	20	16	9	2	5	41	31	10
6.º	Defensores de Belgrano	20	16	7	6	3	36	31	5
7.º	Almagro	18	16	7	4	5	29	24	5
8.º	Excursionistas	18	16	7	4	5	30	29	1
9.º	Colegiales	16	16	6	4	6	38	41	-3
10.º	Talleres (Remedios de Escalada)	16	16	7	2	7	37	44	-7
11.º	El Porvenir	14	16	5	4	7	39	36	3
12.º	Los Andes	12	16	6	0	10	34	37	-3
13.º	Quilmes	12	16	5	2	9	33	36	-3
14.º	Acassuso	12	16	5	2	9	34	49	-15
15.º	Argentinos Juniors	11	16	4	3	9	34	35	-1
16.º	Estudiantes (Buenos Aires)	8	16	3	2	11	28	42	-14
17.º	Sportivo Buenos Aires	4	16	1	2	13	18	60	-42

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TABLA DE POSICIONES

Pos	Equipo	Pts	PJ	G	E	P	GF	GC	DIF
1.º	San Lorenzo (reserva)	56	32	26	4	2	118	32	86
2.º	Boca Juniors (reserva)	55	32	25	5	2	132	44	88
3.º	River Plate (reserva)	55	32	25	5	2	101	36	65
4.º	Banfield	45	32	20	5	7	90	54	36
5.º	All Boys	43	32	17	9	6	95	56	39
6.º	Barracas Central	43	32	18	7	7	67	57	10
7.º	Racing Club (reserva)	42	32	18	6	8	110	59	51
8.º	Temperley	42	32	19	4	9	86	73	13
9.º	Dock Sud	40	32	16	8	8	72	60	12
10.º	Chacarita Juniors (reserva)	37	32	15	7	10	66	64	2
11.º	Defensores de Belgrano	37	32	13	11	8	74	56	18
12.º	Almagro	34	32	13	8	11	61	58	3
13.º	Estudiantes (La Plata) (reserva)	34	32	14	6	12	90	67	23
14.º	Huracán (reserva)	33	32	13	7	12	32	57	-35
15.º	Excursionistas	32	32	12	8	12	67	72	-5
16.º	Platense (reserva)	32	32	13	6	13	80	74	6
17.º	El Porvenir	31	32	12	7	13	73	78	-5
18.º	Colegiales	30	32	12	6	14	73	85	-12
19.º	Independiente (reserva)	29	32	12	5	15	72	77	-5
20.º	Ferro Carril Oeste (reserva)	27	32	11	5	16	69	77	-8
21.º	Gimnasia (La Plata) (reserva)	27	32	11	5	16	64	81	-17
22.º	Los Andes	27	32	11	5	16	65	80	-15
23.º	Talleres (Remedios de Escalada)	27	32	12	3	17	74	85	-11
24.º	Quilmes	26	32	11	4	17	60	66	-6
25.º	Atlanta (reserva)	23	32	10	3	19	65	94	-29
26.º	Argentino de Quilmes (reserva)	22	32	7	8	17	65	85	-20
27.º	Acassuso	22	32	7	8	17	65	100	-35
28.º	Vélez Sarsfield (reserva)	22	32	8	6	18	66	109	-43
29.º	Argentinos Juniors	21	32	8	5	19	69	89	-20
30.º	Lanús (reserva)	21	32	9	3	20	88	114	-26
31.º	Estudiantes (Buenos Aires)	20	32	8	4	20	58	95	-37
32.º	Tigre (reserva)	11	32	3	5	24	39	121	-82
33.º	Sportivo Buenos Aires	10	32	3	4	25	39	115	-76

 

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